学会準備と留学生
6月も半ばですが，梅雨に入ったという感じがしない暑さが毎日続いていますね．
滋賀でも全く雨が降らず，写真のように毎日快晴で暑いです．
しかし，この暑さの中研究室内の服装はこんな感じになっております．
少しわかりづらいかもしれませんが，みんな長袖を来ていたり，中には手前のように上着を着ている人もいます．先々週に少し触れましたが，これは研究室で線虫を飼育しているためです．線虫にとっての最適な温度は20～22℃と言われています．それに合わせて研究室の冷房は20℃になっていて，特にエアコン直下はかなり涼しく感じます．寒がりな人は上着を着るなどして対応してもらっていますが，線虫は上着を脱ぎ着できないので仕方ないです．暑がりな人からするととてもすごしやすいのですが．
また，今週の月曜日から本研究室にタイからの留学生がやってきました．写真中央の女性です．彼女がいるのはほんの2週間ですが，なるべく積極的な交流をしていきたいです．
たった2週間なので，何をしていくか先生方との打ち合わせを密にしています．
また，彼女はタイのお土産をもってきてくれました．
干したバナナやマンゴーのドライフルーツ，変わり種ではドリアンのお菓子もありました．ちょっぴり変わった味でしたが，どれもおいしかったです．
なお，私ともう一人のM1は来週海外の学会に行きますので，そのための発表練習も行いました．
来週にもう一度発表練習を行って，出来る限り万全の状態で学会に臨みたいと思います．
(N.Y)
国際学会へ向けて
今週から梅雨入りとニュースで言われていましたが、
比較的晴れの日が続いた一週間でした。
来週からタイからの留学生が来るということで
みんなで席づくり及びパソコンのセットアップを行いました。
どんな人が来るのかみんなで妄想を膨らませながらながら楽しみにしています。
今週は二週に一回行われる西川建先生を招いての情報生物学研究室討論会が開催されました。発表者は四回生でしたが、堂々たる発表ぶりで、議論も大いに盛り上がりました。
そしてこれまた第二弾です。
つながり学習として、
玉川中学校の生徒さんとバナナからRNAを抽出する実験が
行われました。
先生や院生の指導のもと、生命科学について
楽しく学ぶ機会となりました。
中学生はとても元気で
こちらもパワーを分けてもらったように感じます。
今月は院生三人が学会に行くために
ポスターを作る姿が良く見られました。
初の国際学会ということもあり
準備は入念にしなければなりません。
新たなことにチャレンジするのはとても勇気がいりますが
万全の準備を自信に変えて
頑張りましょう!!!
きっとこれからの人生でも
役に立つ経験になると思います。
(N.T)
暑いけど研究室は涼しい
6月になり気温が高くなってきて、半袖を着ている人も増えてきました。しかし、研究室には線虫がいるため年間通じて温度は一定に管理されています。夏でも涼しくて快適に過ごせます。線虫にはいつもお世話になっています。今回のブログは、先週のブログでも書いた"つながり学習"の続きと立命館大学の学生の食生活について書きます。
(大学の中)
(N.Yさん)
まず、"つながり学習"の続きです。"つながり学習"という授業で玉川中学校の生徒が体験実習に立命館大学にきました。前回は、パソコンでDNAの立体構造を動かしたり、タンパク質との相互作用を見るなどしていました。来週は、バナナからDNAを抽出する実験を行うので、そのための予備実験を行いました。
(つながり学習)
バナナからのDNA抽出の大雑把な流れを説明します。
①バナナをつぶす→②DNA抽出液を調製する→③DNA抽出液をバナナに加える→
④コーヒーフィルターにDNA抽出液を通す→⑤エタノールをいれると白いもやもやとしたDNAが浮いてくる
(①つぶしたバナナ)
(DNA抽出液の調製)
(③バナナにDNA抽出液を添加)
(④バナナをコーヒーフィルターによりろ過)
(⑤DNAの抽出)
無事にDNAが抽出できました。中学生が喜んでくれたらうれしいです。ネットにも簡単に手に入るものだけで行える簡単なDNA抽出の方法がたくさんのっています。ぜひやってみてください。
次は、大学生の食生活についてです。立命館大学には、生協とJAおうみ富士の地元産物の直売所の中にあるレストラン "おうみんち"が行っている100円朝食があります。どちらも100円という値段でおなかいっぱい食べられます。生協の100円朝食は、ご飯、味噌汁、おかず２個で100円です。おうみんちは、カレーと中華丼がありどちらも100円です。
(生協の100円朝食)
("おうみんち"の100円朝食)
昼ごはんは、大学に近くの店が売りに来ている弁当か食堂で食べます。どちらもたくさんの種類があり毎日どれを食べるか迷っています。ほとんど研究室のメンバーで弁当を買いにいって楽しく昼ごはんを食べています。
(生協の昼ごはん)
(弁当)
来週は、研究室の飲み会、情報生物学討論会、"つながり学習"など盛りだくさんです。院生は、6月末の国際学会(C. elegans Conference 2017、国際ゲノム会議)に向けて英語でポスターを頑張って作っています。
つながり学習と発表準備
今週は大津で最高気温が30℃に達するなど、ほぼ夏のように熱い１週間でした．
本研究室でも，写真のように半袖を着るメンバ―が増えてきています．
1週間の始め，月曜日のゼミでは研究の進捗に加えプロポーザルを行い，M1は今週で全員がプロポーザルを終えた状態となりました．次からは院進をする4回生が発表，続いて就活の終わった4回生やM2の発表と続いていく事になります．
ゼミ終了後の研究室の様子．ゼミで教授方に指摘してもらった点の確認や復習，あとは学生内で何か報告があれば大抵このタイミングで行っています．
ゼミで疲れた神経を癒すため，休憩にコーヒー等を淹れて飲んだりもします．
今年はコーヒーを飲む人が多いためか，去年と比べてすごい勢いでコーヒーが消費されています．あまりに消費が早いので，1ダースまとめて注文しました．去年は生協で買うので十分間に合っていたのですが…
さすがにコーヒーを発注したのは初めてだったので，休憩も兼ねて記念に並べてみました．いっぱいあるように見えますが，下手をするとこの量でも３，４ヶ月で消費するかもしれません．
もう暑いので，アイスコーヒーを準備しているところです．このとき作ったのは薄すぎてアレだったみたいですが…
コーヒーは火曜日に届いたのですが，玉川中学校の生徒たちが”つながり学習”と題して体験実習をしに来た日でもありました．この体験実習は何となく意味はわかるし問題なく出来るものでしたので，特にパソコンをいじる段階になると中学生らしく楽しそうにいじっていました．
DNAの立体構造を表記方法を変えてみたり，色を変えたり，角度を変えたりズームしたりといじくりまわしている様子です．続けてタンパク質の水素結合部位だけを別の表記法で強調表示するのを，GUIでなくCUI，コマンドを打ち込む形で行っています．打ち込むコマンド自体は配ったレジュメに全部書いてあるのですが，背景色を変えるコマンドをみて赤だの紫だのに変えてみたり，レジュメに指定されていない表記形式をさせてみたりと，中学生らしく柔軟性あふれる発想でした．
ただ打ち込むコマンドはレジュメに書いてあるとは言っても，何をやってるのかさっぱりなこともあって苦戦する生徒もおり，最後には手が足りなくなってしまい次回実験実習を担当する2人まで呼び出して手伝ってもらいました．とはいえタイプミスや読み間違いなど，実際大学生でも初めての情報系授業だとよくやらかして苦戦するので，彼らはとてもよく頑張っていたと思います．最終的に自分流の表記方法のDNAとタンパク質の立体構造を印刷してもらって，今回の実習は終わりとなりました．
またＭ１は6月の下旬に国際学会で発表してこれるのですが，英語力に不安を感じて音声翻訳アプリを試してみたりもしました．アプリが認識できるような発音でないときちんと訳してくれないとわかったので，やっぱり自力が重要なんだと思います．
毎週木曜日の昼はプレゼミを行っています．学生だけで，任意参加ですがここで最低限でも仕上げておくと，月曜のゼミで教授方からより重要な問題だけを指摘してもらえるので，結構大事です．ここは他の学生がどんな研究をしているのか理解を深める機会でもあり，ゼミよりは質問しやすい雰囲気の筈なので4回生も積極的に質問していってほしいと思っています．
再来週からはいよいよ4回生のプロポーザルが始まります．自分の研究について，なぜやるのか，何の役に立つのか，どうやって結果を得るのか，初めて深く考える機会です．我々M1も出来る限りはサポートしていくつもりなので，頑張っていきましょう．
(N.Y)
文武両道
今週は晴天が続き、研究室に閉じこもっていてはもったいない！！
とにかく体を動かしたい！！
という要望が多くありましたので、
第一回伊藤研大バドミントン大会を開催しました。
天気関係ないやん。という突込みはさておき、日頃の運動不足の解消です。
学校の体育館を貸し切ってみんなで大いに盛り上がりました。
もちろん次の日はみんな筋肉痛です。
また開催しますので文武両道な研究室を目指し、
頑張っていきましょう（個人的な目標）！
さて、少し真面目な話題です。
今週情報生物学研究室に西川建先生がいらして討論会が行われました。
演者はM2の先輩で、研究についての様々な意見を頂きました。
西川建先生はタンパク質構造解析の開拓者の一人で、様々な切り口からのアドバイスは
とても参考になります。
これからも二週に一回討論会は行われますのでたくさんのことを吸収して
今後の研究に励もうと思います。
これらのイベントを重ねてモチベーションの上がった我々の
サブゼミが木曜日に行われました。
筋肉痛で体を引きずりながらではありますが
4回生も交えて各々の研究内容を確認し合い、
お互い質問し合います。
自分の経験談ですが、
学生間でのコミュニケーションや発表練習は
自信につながり、実際の発表で緊張せずに
しゃべることが出来るようになります。
この積み重ねはとても大切です。
線虫が新しく届きました。
この線虫たちの命に感謝して、
研究結果をきちんと発表できるように
これからもがんばっていきましょう。
（N.T）
GWとNGS
５月といえばGWです。GWでリフレッシュして研究に取り組んでいます。特に院生は学会に多く参加するので熱心に研究しています。また、就職活動をしている人も研究と両立しています。今回は研究室の日常と私が行った実験について書きます。
まず、研究室の日常についてです。GWなので卒業生が研究室にきてくれました。研究室での思い出などいろいろ話しました。研究室には卒業生がお土産をもってよく遊びにきてくれます。卒業してからも顔を出したくなるような研究室にしていけたらと思います。
(先輩からのお土産)
(先輩に買ってもらったお菓子)
本研究室の大学院生は多くの学会に参加します。国内だけではなく国外の学会に参加する人もいます。
今参加が決まっている学会(International C.elegans Conference、国際ゲノム会議、日本糖質学会)について紹介します。
(International C.elegans Conference)
(国際ゲノム会議)
(日本糖質学会)
次に、私が今週行った実験について紹介します。次世代シーケンサー NGS(Next Generatio Sequencer)を用いた実験を行いました。NGSはRNAを定量的に解析するものです。RNAとは何でしょう? RNAの働きについて説明します。DNA→RNA→タンパク質となり生体内ではタンパク質が機能しています。DNAは生命の設計図(タンパク質の設計図)といわれています。そのタンパク質をDNAから必要な場所・時間につくる手助けをするのがRNAです。
ただRNAをNGSに入れるだけではうまく解析できません。NGSを使う前には、きれいなRNAが抽出出来ているか確かめる必要があります。そのときに使うのがBioanalyzerです。
(Bioanalyzer)
うまくRNA処理できていないとNGSが止まってしまうことがあるのでドキドキしながらスタートボタンを押しました。写真にあるようにRun completed withtout errorsと画面にあるように実験はエラー無く成功しました。RNAのデータが出たので、これからはデータ解析の解析をします。
(次世代シーケンサー)
(NGS終了の画面)
今週もいろいろありましたが、終わりました。実験の結果が出たら、次はそれを学会で発表するためにポスターにまとめなければいけません。頑張ります。来週は、本研究室談話室で情報生物学討論会が行われるので、討論会などについてブログを書くと思います。
(情報生物学討論会)
(O.Y)
暖かくなってきましたが
ここ最近、日中は随分と暖かくなってきましたが、夜はまだまだ寒くなる今日この頃、皆様いかがお過ごしでしょうか。本研究室では、この温度差に体調を崩した者も（教授方を含めて）何名かいるので、お気を付けてください。特にインフルエンザは先週生命科学部の実験科目を担当なさっておられる先生方に猛威を振るい、危うく休講になるところでした。
今週一週間、本研究室における最初のイベントとして、誕生日会が行われました。
このとき小島先生は先週インフルエンザでお休みになられており、病み上がりでマスクを付けられておられましたが、今はマスクもとられて無事回復なされたようです。
この誕生日会は4回生が初めて主催する誕生日会でしたが、無事問題なく進行しており、この調子で慣れていってほしいと思います。
我々M1は研究予定のProposalを行い始めているので、B4の監督を行いつつ、お互いに文章を確認し合ったり、疑問点・おかしな点を指摘し合ったりしていました。
B4は各自研究を進めていました。就活が忙しい人が多いので、殆ど研究室に来れない人もいますが、来れる人たちは写真のように進めています。
就活が忙しい人は、まだ自分のテーマについて確認している段階ですが、去年の経験から考えると、間に合わないという事はないと思うので、まずは就活を頑張ってほしいと思います。
また、B4同士の横のつながりも出来上がってきたようです。B4同士でも、M1から教わったこと、自分で見つけたことなどを共有していくことは、今後の研究において役に立つことが多いので、この調子で行ってほしいです。
なお、M2の方が本研究室のホームページをアップデートしました。以前のサイトより、各種情報が見やすく且つ充実したので、ぜひ見に行ってください。
（N.Y）
サイトURL: http://www.collabo.sk.ritsumei.ac.jp/~infobio/
